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湖南大学生物信息学与病原学团队:重组导致非洲猪瘟病毒基因组多样性

来源:潇湘晨报作者:李柯夫

编辑: 值班编辑时间:2019-08-16 14:25:21

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  △来源:视觉中国2jv潇湘晨报网

  近日,湖南大学生物信息学与病原学研究团队在国际兽医学权威期刊《Veterinary Microbiology》发表文章称,该团队研究发现重组导致非洲猪瘟病毒基因组多样性。“这也从理论上解释了为何相关疫苗的研发非常困难。”该文章通讯作者、湖南大学生物学院生物信息中心的彭友松副教授说,由非洲猪瘟病毒严重影响生猪养殖业,目前仍然缺少有效的疫苗和药物来防治该病毒,其中很重要的原因在于对该病毒的变异机制缺乏了解。2jv潇湘晨报网

  彭友松介绍说,2018年9月,在湖南大学生物学院院长谭拥军教授的倡议下,生物学院博士研究生朱兆中与肖朝庭副教授开展了相关研究工作。研究团队通过生物信息学方法分析了数据库中已有的39个非洲猪瘟病毒基因组,发现该病毒中基因组片段的插入和缺失(Indel)对于基因组多样性的贡献远大于点突变。为了研究Indel的产生机制,在部分排除了复制滑动和转座等因素之后,发现在非洲猪瘟病毒基因组中大量发生的重组事件与基因组Indel的发生存在明显的关联,因此基因组重组很可能导致了基因组片段Indel(特别是大的Indel)的发生。2jv潇湘晨报网

  大部分重组事件都是基因型特异的,而且发生在基因组的两端。最后,研究团队发现非洲猪瘟病毒基因组中存在的大量重复元件有利于基因组重组的发生,重组进一步导致了病毒基因组的多样性以及病毒表型(如抗原/致病性等)的多样性,极大增加了防控该病毒的难度。2jv潇湘晨报网

  该发现不仅有利于增强对于非洲猪瘟病毒进化机制的理解,而且也为该病毒的防控提供了一定的科学依据。彭友松表示,该项工作受到国家重点研发计划,国家自然科学基金和湖南省自然科学基金等基金的支持。该研究目前仍处于实验室阶段,相关结论也是根据数据分析得出,未来还需要用实验进行证实。同时,实验室还用计算的方式预测了一些药物,其有效性也需要通过实验来证实。2jv潇湘晨报网

  潇湘晨报记者李柯夫2jv潇湘晨报网